Các hiệu trưởng Trường Phổ thông Năng khiếu thường giữ chức vụ kiêm nhiệm

Trường Phổ thông Năng khiếu là đơn vị trực thuộc Đại học Quốc gia TPHCM, được thành lập ngày 4-7-1996, là cơ sở trường THPT đầu tiên ở phía Nam trực thuộc đại học.

Việc tên trường không có chữ "trung học" để nhằm phân biệt với các trường THPT trực thuộc Sở Giáo dục và Đào tạo TP.HCM.

Trường có nhiệm vụ phát hiện và đào tạo học sinh có năng lực học tập vượt trội, áp dụng các phương pháp giảng dạy tiệm cận với môi trường đại học, tạo nền tảng tư duy để học sinh trở thành nguồn sinh viên chất lượng cao trong các lĩnh vực để phục vụ cho sự nghiệp phát triển đất nước.

Trong 29 năm hình thành và phát triển, các thế hệ học sinh của Trường Phổ thông Năng khiếu đã đạt rất nhiều thành tích cao trong các kỳ thi quốc tế, đóng góp nhiều thành tựu trong lĩnh vực công tác, có uy tín với xã hội.

Như vậy, ban giám hiệu Trường Phổ thông Năng khiếu hiện nay gồm: TS Bùi Thị Hồng Hạnh - hiệu trưởng và hai phó hiệu trưởng là TS Trần Nam Dũng và ThS Trần Vũ.

Hiệu trưởng trước đó của trường là GS.TS Nguyễn Thị Thanh Mai - kiêm phó giám đốc Đại học Quốc gia TP.HCM.

Các hiệu trưởng của Trường Phổ thông Năng khiếu trước đó thường là hiệu trưởng hoặc phó hiệu trưởng Trường đại học Khoa học tự nhiên (Đại học Quốc gia TP.HCM) kiêm nhiệm.